2003年，南京供电公司《安全监察管理系统》获得2003年江苏省电力公司管理创新成果三等奖，同时还荣获全国电力行业企业管理现代化创新成果三等奖。
2008年，南京供电公司《刘平工作室创建与创新管理》、《以精简、高效为目标的供电企业扁平化组织机构的创建》荣获全国电力行业企业管理创新成果二等奖。
2009年，南京供电公司《供电企业青年员工职业生涯规划引导》、《以安全、规范、有序、有偿为目标的电力杆线安全整治》、《配送物资少库存管理》分获江苏省电力公司2008年度管理创新成果二、三等奖。
2013年，南京供电公司荣获江苏省电力公司2010-2012年度管理创新先进单位。
2013年，南京供电公司以承办第二届夏季青年奥林匹克运动会和第二届亚洲青年运动会为契机，加强南京电网2013年迎峰度夏暨亚青会供电保障应急联合演练，提炼形成《供电企业重大活动“四强三零”电力保障管理体系构建与实施》，荣获国家级管理创新成果二等奖和全国电力行业管理管理创新成果一等奖，首次实现公司在国家级成果上的“零突破”。
2016年，南京供电公司荣获江苏省管理创新优秀企业.称号，成为公司系统首家获此殊荣的单位；2018年，公司率先通过江苏省管理创新示范企业评审和公示。
2016年,《电力集体企业基于信息化的业财协同管理》等2项成果获第二十三江苏省企业管理创新成果一等奖，另获二等奖3项，获奖数量和质量位居全省前列。
2017年3月27日，南京供电公司《大型供电企业面向市场的一体化柔性运营管理》荣获第二十三届全国企业管理现代化创新成果一等奖，成为公司系统唯一一家市级供电公司获此殊荣的单位，充分体现了公司管理创新的成绩
2018年2月2日，南京供电公司《能源互联网背景下国家级新区城市电网转型发展管理》荣获国网公司2017年度管理创新成果二等奖，为公司首次摘得该等级奖项，另《基于智能运检技术的智能电网示范区运检模式变革与实践》获推广成果三等奖